Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Nfe2l3Q9WTM4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Nfe2l3Q9WTM4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Nfe2l3Q9WTM4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nfe2l3Q9WTM4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nfe2l3Q9WTM4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nfe2l3Q9WTM4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nfe2l3Q9WTM4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nfe2l3Q9WTM4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Nfe2l3Q9WTM4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms