Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psma1Q9R1P4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms