Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav3Q9R0C8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav3Q9R0C8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav3Q9R0C8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav3Q9R0C8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav3Q9R0C8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav3Q9R0C8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms