Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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