Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms