Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms