Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Six6Q9QZ28 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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