Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms