Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms