Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms