Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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