Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim44Q9QXA7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms