Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolkQ9QUG2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms