Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms