Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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