Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms