Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms