Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms