Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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