Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms