Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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