Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms