Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ftsj3Q9DBE9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms