Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtr1Q9DBC3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms