Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms