Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9DA42 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9DA42 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms