Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cnot8Q9D8X5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cnot8Q9D8X5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cnot8Q9D8X5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot8Q9D8X5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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