Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms