Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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