Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms