Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms