Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms