Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stag1Q9D3E6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms