Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms