Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp35Q9D384 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms