Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Tmed11Q9D2R4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Tmed11Q9D2R4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Tmed11Q9D2R4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmed11Q9D2R4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmed11Q9D2R4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed11Q9D2R4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmed11Q9D2R4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmed11Q9D2R4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmed11Q9D2R4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmed11Q9D2R4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmed11Q9D2R4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tmed11Q9D2R4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed11Q9D2R4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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