Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms