Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms