Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms