Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms