Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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