Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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