Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUK2

Gm10306, Predicted gene 10306 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10306Q9CUK2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm10306Q9CUK2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10306Q9CUK2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10306Q9CUK2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10306Q9CUK2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10306Q9CUK2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm10306Q9CUK2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm10306Q9CUK2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10306Q9CUK2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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