Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snw1Q9CSN1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms