Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms