Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms