Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubl4bQ9CQ84 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubl4bQ9CQ84 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubl4bQ9CQ84 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubl4bQ9CQ84 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubl4bQ9CQ84 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubl4bQ9CQ84 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl4bQ9CQ84 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms