Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms