Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms