Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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